為了獲得大量的AKP基因,我們需要將目的基因通過pcr擴增基因劑量,方便下一步實驗作基因重組。
我們需要注意PCR產物的準確性和產率。特別注意引物、復性溫度、taqE對準確性的影響和延伸時間(1000bp/min)、Mg2+濃度、循環數(小于等于30)對產率的影響。
同時,我們要掌握PCR基因擴增及擴增產物的回收的基本原理和實驗技術方法。
實驗原理及過程
實驗步驟
實驗原理
1 PCR體系的準備和PCR擴增的開始
2.5mmol/L dNTP Mixture 4.0uL
10xbuffer Mg2+ Ex-TaqE ddH2O 40uL
primer 4uL
模板DNA 2uL
940C,2’ 940C 1’ 420C 1’ 720C 2’ 720C 10’ I-------30cycles----I
聚合酶鏈式反應(Polymerase Chain Reaction),即PCR技術。
在合適條件下,這種循環不斷重復,前一個循環的產物可作為后一循環的模板參與DNA的合成,zui終使產物DNA的量按2n方式擴增。
理論上講經過30次的循環反應,DNA擴增倍數為106-109。
PCR引物的設計至關重要,3’端要嚴格配對,5’可以引入酶切位點,也可以由此控制Tm值和CG的比值。
TaqE有zui適溫度和反應的活性,要注意它有加尾活性。
循環數超過30個以后,因為產物數量增加和反應物數量的減少,反應速度降低,這時對反映的產率已經沒有貢獻,反而副產物增多,影響效果。所以,循環數不應超過30。
2 PCR產物電泳
0.8 %Agarose(1×TAE) 80伏恒壓電泳
全部PCR產物上樣電泳:
6uL 10xloading
6uL SYBR
marker部分:
10uL marker(含loading buffer)
1uL SYBR
因為PCR產物會有一些副產物,所以要用電泳的方法分離各種PCR產物。這樣也能分離TaqE等雜質。
為了分辨PCR產物和PCR副產品,需要跑一個分子量marker,我們的產物是1.6kp。
用TAE的原因是高嚴可以降低Agarose熔點,促進之后的DNA 吸附。
3 PCR產物的回收(玻璃奶吸附法)
1)
紫外燈下切膠,稱膠重
SYBR會使DNA部分顯出綠色熒光,在紫外燈下辨認綠色熒光,可將膠切下。
2)
每100mg膠加入300 uL溶膠液,50 oC溶膠
讓DNA充分釋放到液體中。
3)
將在-20 oC凍存的玻璃奶解凍,振勻!!
玻璃奶為細微的玻璃小顆粒,因酷似奶狀而得名。它為懸濁液,而可以起吸附作用的小顆粒會沉降下來,所以,只有搖勻,我們才能渠道足量的玻璃小顆粒,完成分離的過程。
4)
在溶解后的膠液中加入10 uL玻璃奶,吹打均勻,冰浴沉淀10min, 10,000rpm離心1min,去上清。
這是一個類似于吸附層析的過程。DNA會特異的吸附于玻璃奶的小顆粒上,而膠不會吸附于其上,故可以起到分離的效果。
高鹽能促進吸附。
5)
在離心所得沉淀中加入200 uL稀釋濃縮洗膠液(3體積濃縮洗膠液加入7體積無水乙醇即得稀釋液),吹打均勻,10,000rpm離心1min,去上清,如此洗兩次。
這是一個洗滌的過程。
6)
50 0C干燥。
7)
加入20 uL TE,吹打均勻,60 oC 5-10min 溶解DNA,12,000rpm 2min,收集上清為回收的PCR產物,-20oC保存。
此步驟是解析。
讓DNA釋放到溶液中,李新的方法可以將DNA純化。
低鹽有利于解吸附。
8)
檢測是否含有DNA
取2uLDNA混合0.5uLSYBR,直接到紫外燈下觀察,若有綠色熒光,則證明有DNA存在。
實驗結果及分析
本次試驗中,在zui后一步檢測中看到了熒光,說明了DNA的存在,證明回收到了PCR的產物。
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