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優化sgRNA結構可提高基因編輯效率!

閱讀:583發布時間:2016-3-3

優化sgRNA結構可提高基因編輯效率!

在一項新的研究中,來自美國德州理工大學健康科學中心的研究人員開發出一種提高CRISPR基因編輯效率的方法,其中CRISPR是一種日漸重要的用來編輯DNA的技術。相關研究結果近期發表在Genome Biology期刊上,論文標題為“Optimizing sgRNA structure to improve CRISPR-Cas9 knockout efficiency”。論文通信作者是Haoquan Wu博士。他是德州理工大學健康科學中心的一名生物醫學家。

Wu說,“*的科學家們如今正在他們的研究中使用CRISPR,但是這種技術的功能性并不像是它應當那樣的那么好。”

CRISPR是一種突破性的允許科學家們對基因進行修飾的技術。兩種關鍵性的組分讓CRISPR的DNA編輯能力成為可能。*種組分是Cas9,即一種能夠切割DNA的酶。第二種組分是單向導RNA(single guide RNA, sgRNA),它地引導Cas9在一種DNA序列上進行切割從而讓不需要的片段失活。

然而,作為一種新技術,CRISPR仍然還有改善的空間。這種技術剔除或敲除基因的能力并不是始終一致的。這些問題促使Wu想知道他是否能夠提高CRISPR作用于靶基因并將其移除的整體能力。為此,他想看看改變sgRNA的結構是否能夠讓這種技術變得更好。

在這項新的研究中,Wu和他的研究小組描述了他們如何能夠通過調整sgRNA模板的序列讓基于CRISPR的基因敲除能力提高了50%。他們特異性地將sgRNA延長大約5個堿基對(bp),同時也將sgRNA中的一串胸腺嘧啶(T)的第四個堿基T突變為胞嘧啶(C)或*(G)。

Wu說,“通過這些優化,基因敲除效率提高的程度是顯著性的。這將有助降低基因敲除實驗可能并不成功的擔憂,而且也顯著增加更多充滿挑戰性的諸如基因剔除之類的基因編輯方法的效率。”

Wu和他的研究小組計劃繼續研究這種經過修飾的sgRNA模板以便更好地理解它為何提高CRISPR的基因編輯功能。他們已經將這種新的方法申請了。


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