elisa檢測(cè)試劑盒有了基因組序列，Baker等研究人員能夠鑒定出同時(shí)進(jìn)化的氨基酸，即時(shí)它們?cè)谖凑郫B的鏈上彼此不相鄰。這些事件表明，這些氨基酸在折疊蛋白質(zhì)中是鄰居，為研究人員研究蛋白結(jié)構(gòu)提供了線索。結(jié)構(gòu)上的接近可以提示功能關(guān)系，以及自然選擇在功能上的作用。
在蛋白質(zhì)家族數(shù)據(jù)庫(kù)Pfam中有接近15,000個(gè)蛋白質(zhì)家族。對(duì)于近三分之一的家族，每個(gè)家族中至少有一種已通過實(shí)驗(yàn)確定其結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)。對(duì)于另三分之一的家族，可根據(jù)一定程度的置信度建立比較模型。然而，對(duì)于另外5211個(gè)蛋白家族，目前沒有任何結(jié)構(gòu)信息。
研究人員確定了建模所需的序列數(shù)量，開發(fā)出模型質(zhì)量的標(biāo)準(zhǔn)，并且在可能的情況下，將預(yù)測(cè)的接觸與已知結(jié)構(gòu)進(jìn)行匹配來(lái)改進(jìn)建模。這種方法預(yù)測(cè)出614個(gè)蛋白質(zhì)家族的結(jié)構(gòu)模型，其中約140個(gè)帶有PDB中未出現(xiàn)的折疊。這種方法提供了大蛋白家族的代表性模型，向著蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)計(jì)劃的目標(biāo)邁進(jìn)了一大步。
elisa檢測(cè)試劑盒JGI的Nikos Kyrpides表示，Baker實(shí)驗(yàn)室與JGI之間的合作讓團(tuán)隊(duì)提出了一個(gè)強(qiáng)大的方法來(lái)預(yù)測(cè)結(jié)構(gòu)和結(jié)構(gòu)比對(duì)。“正如預(yù)期的那樣，當(dāng)我們?cè)黾恿撕昊蚪M學(xué)數(shù)據(jù)，利用我們數(shù)據(jù)庫(kù)中50億個(gè)組裝好的宏基因組序列，我們能夠明顯增加許多已知蛋白家族的覆蓋。”
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elisa檢測(cè)試劑盒
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