近年來,隨著檢測參數越來越多,流式細胞儀也日漸普及。不過,盡管多個參數同時分析可帶來大量信息,但在樣品制備過程中必須采取適當的措施,才能保證流式數據是相關的。如何才能少走彎路,下面聽聽各位專家的建議。
1. 從采集那一刻開始
流式分析所用的樣品是十分多樣化的,從細胞、血液到組織等。這些需要不同的樣品采集和處理方法。“血液或組織樣品通常在分析前幾天、幾周甚至幾個月采集,比如大型隊列研究,”美天旎的產品經理Johannes Fleischer解釋說,“若保存不當,可能會影響結果。為了實現高度標準化,建議使用專門的組織保存試劑、冷凍干燥或保存在-80℃,以減少實驗可變性。”
2. 是否需要富集細胞?
BioLegend的技術服務專家Ekaterina Zvezdova表示:“通常,人們利用抗體或細胞因子等刺激物處理后,使用流式細胞儀來評估細胞的活化狀態。然而,對細胞的刺激往往會導致表面受體內化。例如,抗CD3抗體對T細胞的刺激導致T細胞表面的TCR/CD3復合物下調,因此無法通過CD3或TCR分子來鑒定異質群體中的T細胞。”
他認為,研究人員需要預測不同處理方式對特定細胞標志物的影響,從而制定有效的策略來收集數據。比如,在細胞鑒定時采用替代性的譜系標志物,或者在刺激之前就富集感興趣的細胞亞群。
Fleischer也強調了富集細胞的好處。他解釋說,稀有細胞,比如循環腫瘤細胞、造血干細胞和抗原特異性T細胞,在流式實驗中是很難捕獲的。“使用與抗體偶聯的磁珠,可以富集這些稀有細胞,”他說。美天旎的MACSQuant Analyzer流式細胞儀可與磁性富集柱相整合,從而實現自動化的細胞富集。
3. 解離細胞有何影響?
*,流式分析需要單細胞懸液,因此當研究人員分析實體組織的細胞時,首先需要解離樣品。機械解離和酶解消化都是常用的方法,但兩者都會引起細胞應激,并導致細胞存活率不高。
“為了提高重復性,我們開發出GentleMACS?解離設備,這種自動化的儀器帶有預先設好的程序,可以更溫和地解離特定的生物材料,”Fleischer解釋說。“我們還設計出一系列組織特異性的解離緩沖液,作為GentleMACS設備的補充。我們已經生成了大量的測試數據,證明它們可以更好地保留細胞表面的表位。”
Zvezdova也指出,酶解消化往往會影響抗體結合的表位。“例如,貼壁細胞經過胰蛋白酶處理會導致鈣粘蛋白的切割和失活,使得對應的抗體難以識別其靶點。為了減少這些影響,使用更溫和的解離溶液是明智之舉,如Accutase?。”
無論采用哪種形式的解離,Fleischer都建議使用細胞濾網進行過濾,以去除樣品中的團塊。“大多數研究人員在流式分析中都遇到過進樣管堵塞的痛苦時刻,而細胞濾網是避免堵塞和外溢的關鍵工具,”他說。
4. 固定也需要優化
固定這個步驟也會影響抗體結合表位。一些抗體用于固定細胞染色時表現出信號損失。“我們對一些抗體克隆進行了內部測試,比較了未固定的細胞以及染色前用4%多聚甲醛固定的細胞,”Zvezdova說。“這些結果顯示了固定表位的染色是否有可能成功,如果您的抗體克隆未提供相關信息,我們通常建議在固定細胞前進行表面染色。”
溫度也會明顯影響抗體結合,導致趨化因子和細胞因子受體等表面蛋白的快速內化。如果要在固定前對細胞進行染色,那么在室溫或37℃下進行抗體孵育,而不是4℃。
5. Fc封閉可降低背景
抗體與免疫細胞上的Fc受體結合是造成背景染色的主要原因,會導致假陽性結果,或掩蓋低豐度靶點的存在。因此,在開展免疫染色之前,加入Fc封閉步驟。“盡管使用Fc封閉試劑可減少背景染色,但這會導致實驗操作中多了一步,并可能造成細胞損失,”Fleischer指出。
“為了讓Fc封閉不再成為必需,我們開發出了REAfinity?重組抗體。這些抗體的Fc區域經過改造,不再與Fc受體結合,能夠產生一致性更好的流式分析數據,”他說。
6. 巧用活細胞染料
Nanna Therapeutics的科學家Catherine Klapholz認為:“在樣品制備過程的多個階段進行細胞計數,以確認未出現明顯的細胞損失,這是一種明智的做法?;罴毎玖峡商峁┯杏玫男畔?,告知不同的制備技術對整個細胞群的影響。不過,必須測試染色的穩定性。數據采集有時需要1-2小時,并且是在室溫甚至4℃下,則信號有可能會急劇增加。”
無論我們對樣品制備過程采用多么精心的優化,但適用于A細胞的方案不一定適用于B細胞,正所謂“甲之蜜糖,乙之pi霜”。只有為每種細胞量身定制不同的樣品制備方案,我們的流式細胞分析才有可能獲得成功。
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