小麥源性成分探針法熒光定量PCR試劑盒通用原則:
1, 先選擇好探針,然后設計引物使其盡可能的靠近于探針。
2, 擴增子的長度應不超過400bp,理想的*能在100-150bp內,擴增片斷約短,有效的擴增反應就越容易獲得。較短的擴增片斷也容易保證分析的一致性
3, 保持GC含量在20%和80%之間,GC富含區容易產生非特異反應,從而會導致擴增效率的降低,及在SG分析中非特異信號。
4, 為了保證效率和重復性,應避免重復的核苷酸序列,尤其是G(不能有4個連續的G)
5, 將引物和探針互相進行配對檢測,以避免二聚體和發卡結構的形成。
b),探針設計指導
1,在設計引物之前設計探針
2,探針的Tm值應在68-70℃之間,如果是目測探針,則要仔細審查GC富含區。
3,探針的5’端要避免有鳥an酸,5’G會有淬滅作用,即使被切割下來這種淬滅作用也還會存在
4,選擇C多于G的鏈作探針,G的含量多于C會降低反應效率,這時就應選擇配對的另一條鏈作為探針。
6, 探針應盡可能的短,不要超過30個bp。
7, 檢測探針的DNA折疊和二級結構。
MLF, 小鼠淋巴成纖維細胞
mRTEC, 小鼠腎小管上皮細胞
CSC, 小鼠心肌細胞
小鼠骨髓間充質干細胞(BMSCs)
MEF, 小鼠胚胎成纖維細胞
MM, 小鼠小膠質細胞
mCF, 小鼠心臟成纖維細胞
MN-c, 小鼠皮質神經元
細胞名稱
人絨毛膜毛細血管內皮細胞
人羊膜上皮細胞
人絨毛間充質成纖維細胞
人羊膜間充質基質細胞
人絨毛膜間充質基質細胞
NRK-52E,大鼠腎細胞
H9c2大鼠心肌細胞(ATCC來源)
C2C12, 小鼠肌原細胞
NIH/3T3, 小鼠成纖維細胞系
大鼠骨髓間充質干細胞(BMSCs)
HSC-T6, 大鼠肝星狀細胞系
CHO, 中國倉鼠卵巢細胞系
COS-7L, 非洲綠猴腎成纖維細胞
SF9, 昆蟲卵巢細胞
BRL 3A, 大鼠肝正常細胞
HK-2, 人腎皮質近曲小管上皮細胞
HET-1A, 人食管上皮細胞
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