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閱讀:108發(fā)布時間:2014-03-17
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中國學者NatureMedicine解析DNA檢測技術(shù)
香港中文大學醫(yī)學院副院長、李嘉誠健康科學研究所所長盧煜明前天(9月18日)下午從**的手中接過了發(fā)展中國家*(TWAS)頒發(fā)的科學獎證書,這是TWAS年度zui高獎的里亞斯特獎,為此盧教授十分激動,他表示沒有想到國家zui高領導人會親自為獲獎者頒獎,由此可以看出國家對科學發(fā)展的極度重視。
盧教授以產(chǎn)前診斷方面的研究著稱,曾發(fā)現(xiàn)過新型非侵入性檢測技術(shù),突破了傳統(tǒng)的侵入性羊膜穿刺檢測方式,大大降低了孕期診斷風險。近期其研究組又在Nature Medicine雜志上發(fā)文,點評了一項利用母體血液,檢測判斷胎兒是否患有唐氏綜合征的研究進展。
目前臨床上對胎兒的唐氏綜合征篩查通常是通過從孕婦羊水或胎盤中提取樣本進行檢測來完成的。不過這些化驗方法都存在導致孕婦流產(chǎn)的危險,而驗血篩查的方法則能避免這種意外,并且確診的時間較現(xiàn)有的方式更早。
這篇由幾國研究人員完成的研究利用胎兒特殊的DNA甲基化比率,進行無創(chuàng)檢測,篩查出14例唐氏綜合征患兒和26例正常胎兒,是這一研究領域的一項進步。對此盧教授等人9月發(fā)出題為“Technical concerns about immunoprecipitation of methylated fetal DNA for noninvasive trisomy 21 diagnosis”的文章,提出了關(guān)于這篇文章中采用技術(shù)的一些疑問。
這項研究主要聚焦于一些差異甲基化區(qū)域,用以顯示母體和胎盤血液DNA中不同的甲基化模式,研究人員采用了甲基化DNA免疫沉淀(methylated DNA immunoprecipitation,MeDIP)方法,通過實時定量PCR分析患有21-三體綜合征缺陷的母體血液DNA提取物樣品,從而指出胎兒特異性DNA甲基化比率能用于21-三體綜合征,也就是唐氏綜合癥的無創(chuàng)檢測。
研究中采用的甲基化DNA免疫沉淀MeDIP技術(shù),是一種富集甲基化DNA的方法。在該方法中,可與5mC特異性結(jié)合的抗體加入到變性的基因組 DNA片段中,從而使甲基化的基因組片斷免疫沉淀,形成富集。通過與已有DNA微芯片技術(shù)相結(jié)合,從而進行大規(guī)模DNA甲基化分析。該方法簡便,特異性高,適合DNA甲基化組學(DNA Methylome)的分析。
目前不少研究將這種技術(shù)與高通量測序結(jié)合起來,通過5"-甲基胞嘧啶抗體特異性富集基因組上發(fā)生甲基化的段,進行高通量測序,快速有效地尋找基因組上的甲基化區(qū)域,從而比較不同細胞、組織、甚至疾病樣本間的DNA甲基化修飾模式的差異。
在無創(chuàng)診斷中采用這種技術(shù),需要注意多個方面,由此盧教授提出了疑問,而前文作者Philippos C Patsalis也對此進行了解答,提出了理論上和實際上的解釋,證明MeDIP在檢測21-三體綜合征中的應用。
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