2013年10月17日 15:00上海撫生實業有限公司點擊量：252
芯片和降解組測序揭示掌葉半夏miRNAs新信息掌葉半夏（Pinellia pedatisecta）是中醫中zui重要的中草藥之一，可治腫毒，具有止嘔，化痰，消腫，止痛等功能。MicroRNAs（miRNAs）是內源性非編碼小RNA，在植物基因表達調控中發揮關鍵作用。但目前在miRBase上仍沒有掌葉半夏的microRNAs信息，并且對其相關生物學功能的研究仍然不足。近日，浙江理工大學的徐濤教授的團隊對掌葉半夏的miRNAs進行了深入研究，研究成果發表在9月刊的PLoS One上。
為了檢測掌葉半夏中的miRNA并分析其與半夏miRNA的表達差異，研究人員根據miRNAs的保守性，從miRBase數據庫上搜集了43個植物物種的成熟體miRNAs序列，采用定制化miRNA芯片對掌葉半夏的miRNAs進行檢測（定制化miRNA芯片服務由聯川生物完成）。從掌葉半夏和半夏中檢出共有的屬于22個miRNA家族的101個miRNAs，其中有21個miRNAs在兩個品種間存在表達差異。研究人員進一步對差異表達miRNAs的靶基因進行GO富集分析，發現這些miRNAs主要影響復制，轉錄因子活性和植物發育過程。
為了闡明miRNA的靶向調控功能，研究人員從掌葉半夏葉子中構建了一個降解組文庫，并對其進行高通量測序（降解組測序服務由聯川生物完成）。結果表明，共有18個轉錄本被鑒定為miRNA的靶基因，進一步分析表明，miR156和miR529可能共同抑制SPL14（SBP-box基因家族）發揮作用。
本研究為進一步研究掌葉半夏中miRNA與其靶基因的調控作用打下了扎實的基礎。
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